就像过去的都指挥使司，只不过将领不是世袭，而是民兵推选几个候选人然后副元帅府任命而已。
这样就很大程度上避免了民兵将领恢复卫所化。
实际上接下来民兵体系的权力必须逐步削减。
文官政府才是未来。
之前只不过是因为杨丰手中没有符合自己标准的文官，所以不得不使用民兵系统，但现在他有自己的文官队伍了，当然要转向文官政府。
九千岁的大逮捕，已经证明民兵体系的很多问题。
而应天还是两套班子。
相国府管民，副元帅府管军。
只不过京城的权力彻底解除，虽然那里依旧是大明都城，但因为应天监国实际上转回南京，而皇帝在奉天，京城只剩下了个皇后带着个废太子，朝廷各衙门全部裁撤。现在那里已经重新归属顺天巡抚，依然统辖顺天，永平，但加上了宣府，大同归入山西，目前山西巡抚驻大同，而留守司和民兵系统同样纳入副元帅府。
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